Atualmente o Curso de Farmácia da Unifesp possui os seguintes tempos de integralização.
| Tempo de integralização | Integral | Noturno |
| Matriz Curricular 2015 | 5 anos | 6 anos |
| Matriz Curricular 2020 ; 2023 | 10 semestres | 12 semestres |
| Carga Horária segundo a Organização Curricular | Matriz Curricular 2015 (Horas) | Matriz Curricular 2020 ; 2023 (Horas) |
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Unidades Curriculares Fixas |
3.438 | 3.618 |
| Unidades Curriculares Eletivas | 506 | 360 |
| Estágio Curricular Supervisionado Obrigatório | 1.025 | 1.030 |
| Atividades Complementares | 120 | 100 |
| Trabalho de Conclusão de Curso (TCC) | 36 | 36 |
| TOTAL | 5.125 | 5.144 |